Nadir şahın 1747-ci ildə öldürülməsindən sonra Əfşarlar imperiyasında mərkəzi hakimiyyət zəiflədi və Azərbaycanın müxtəlif bölgələrində müstəqil və yarım-müstəqil xanlıqlar meydana gəldi. Bu dövrdə Pənahəli xan Cavanşir Qarabağ xanlığının əsasını qoydu.
Bayat qalası
Pənahəli xan ilk olaraq 1748-ci ildə Ağcabədi yaxınlığında Bayat qalasını inşa etdirdi. Qala möhkəm hasar və xəndəklərlə əhatə olunmuş, içərisində bazar, hamam və məscid tikilmişdi. Ətraf bölgələrdən, hətta Təbriz və Ərdəbildən sənətkarlar və ailələri Bayat qalasında məskunlaşmışdılar. Lakin Bayat qalası fasiləsiz davam edən müharibələr şəraitində xanlığın təhlükəsizliyini tam təmin edə bilmirdi.
Şahbulaq qalası
Daha etibarlı müdafiə məqsədilə Pənahəli xan 1751-1752-ci illərdə Ağdam yaxınlığında, Şah bulağı adlanan yerdə Şahbulaq qalasını tikdirdi. Burada daşdan inşa edilmiş qala, məscid, hamam və bazar kimi tikililər mövcud idi. Pənahəli xan ailəsi və yaxınları ilə birlikdə Bayat qalasından Şahbulaq qalasına köçdü. Lakin bu qala da tam təhlükəsizlik təmin edə bilmədiyindən, daha möhkəm bir qala tikmək qərarına gəldi.
Şuşa qalası
Pənahəli xan 1752-ci ildə dağların içində, əlçatmaz və möhkəm bir yerdə yeni bir qala — Şuşa qalasının tikintisinə başladı. Dəniz səviyyəsindən 1300-1600 metr hündürlükdə yerləşən bu qala, üç tərəfdən sıldırım qayalarla, dördüncü tərəfdən isə möhkəm qala divarları ilə əhatə olunmuşdu. Şuşa qalası həm müdafiə baxımından əlverişli, həm də strateji əhəmiyyətə malik idi. Pənahəli xanın ölümündən sonra qala yerləşdiyi relyefə uyğun olaraq Şuşa adlandırıldı.
Pənahəli xanın inşa etdirdiyi bu qalalar Qarabağ xanlığının müdafiə qabiliyyətini artırmış və bölgənin siyasi, iqtisadi və mədəni inkişafında mühüm rol oynamışdır.